MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ignicoccus hospitalis KIN4/I chromosome

Total Repeats: 2083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009776	CTC	2	6	111	116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009776	GCC	2	6	2010	2015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009776	ACC	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009776	CT	3	6	2043	2048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009776	CGG	2	6	2090	2095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009776	CCG	2	6	2097	2102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009776	A	7	7	3888	3894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009776	GGT	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009776	CAC	2	6	4008	4013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009776	GC	3	6	5674	5679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009776	TCGCA	2	10	5695	5704	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009776	GTC	2	6	11939	11944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009776	AGG	2	6	14425	14430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009776	GAC	2	6	16684	16689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009776	GTG	2	6	21576	21581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009776	AAG	2	6	26845	26850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009776	CCTC	2	8	26862	26869	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009776	AGG	2	6	26889	26894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009776	TCT	2	6	26902	26907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009776	CCCCTC	2	12	26924	26935	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
21	NC_009776	TAGA	2	8	26991	26998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009776	TTA	2	6	27012	27017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009776	ATT	2	6	27101	27106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009776	TGT	2	6	27116	27121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009776	GTT	2	6	27122	27127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009776	TC	3	6	27169	27174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009776	TAA	2	6	27287	27292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009776	GC	3	6	27294	27299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009776	CCA	2	6	28528	28533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009776	GAG	2	6	30080	30085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009776	GCG	2	6	30124	30129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009776	CG	3	6	30155	30160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009776	GGCCG	3	15	30213	30227	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009776	TTA	2	6	30248	30253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009776	CGC	2	6	32451	32456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009776	GCG	2	6	32462	32467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009776	GAGG	2	8	32469	32476	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009776	A	6	6	32496	32501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009776	GCGT	2	8	35241	35248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009776	AGT	2	6	35280	35285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009776	T	6	6	37646	37651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009776	AAT	2	6	37711	37716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009776	AGA	2	6	37754	37759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009776	T	6	6	37977	37982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009776	GCT	2	6	40159	40164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009776	CG	3	6	40199	40204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009776	TGGGA	2	10	40212	40221	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009776	CCG	2	6	40231	40236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009776	CGT	2	6	40287	40292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009776	CTC	2	6	40344	40349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009776	CAT	2	6	40372	40377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009776	CT	3	6	40379	40384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009776	TAA	2	6	40412	40417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009776	TCC	2	6	40418	40423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009776	TGG	2	6	40470	40475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009776	CAA	2	6	45095	45100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009776	TGA	2	6	46296	46301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009776	CTC	2	6	50197	50202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009776	GTC	2	6	52470	52475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009776	CGA	2	6	53982	53987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009776	GAG	2	6	54045	54050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009776	GTG	2	6	54988	54993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009776	GATC	2	8	55727	55734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009776	TTC	2	6	56297	56302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009776	TGGCGC	2	12	56306	56317	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009776	ATTTT	2	10	56334	56343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009776	GCG	2	6	56346	56351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009776	TTA	2	6	56370	56375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009776	TAA	2	6	56405	56410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009776	TC	3	6	56509	56514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009776	CCCGGC	2	12	56527	56538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009776	ACG	2	6	56569	56574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009776	GAGG	2	8	57302	57309	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009776	TC	3	6	58640	58645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009776	TCCT	2	8	61013	61020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009776	TAC	2	6	61426	61431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009776	AAG	2	6	61459	61464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009776	GGA	2	6	62502	62507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009776	AGG	2	6	62540	62545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009776	ATG	2	6	62547	62552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009776	CGC	2	6	62603	62608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009776	CGA	2	6	62619	62624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009776	GAT	2	6	62678	62683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009776	ATC	2	6	62747	62752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009776	C	6	6	62835	62840	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_009776	CGA	2	6	64011	64016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009776	GC	3	6	65073	65078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009776	CGG	2	6	66673	66678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009776	CAC	2	6	69649	69654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009776	CG	3	6	69688	69693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009776	G	6	6	69701	69706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009776	AAG	2	6	69761	69766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009776	CG	3	6	69767	69772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009776	ATT	2	6	72116	72121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009776	CTC	2	6	74229	74234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009776	GT	3	6	74258	74263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009776	CGT	2	6	74280	74285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009776	GCG	2	6	74351	74356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009776	CCG	2	6	76569	76574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009776	GCGG	2	8	76614	76621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009776	CGG	2	6	76640	76645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009776	GAC	2	6	76703	76708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009776	CGG	2	6	82133	82138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009776	AGA	2	6	82143	82148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009776	CCT	2	6	84233	84238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_009776	CG	3	6	84248	84253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009776	AT	4	8	84273	84280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009776	GGT	2	6	84824	84829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009776	GC	3	6	85046	85051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009776	C	6	6	87372	87377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_009776	CCG	2	6	87448	87453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009776	A	6	6	88132	88137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009776	AGC	2	6	88580	88585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009776	ACC	2	6	89042	89047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009776	TCGA	2	8	89051	89058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009776	GAG	2	6	89062	89067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009776	CT	3	6	89087	89092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009776	TG	4	8	89127	89134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009776	CT	3	6	89155	89160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009776	CCTC	2	8	89178	89185	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_009776	CT	3	6	89217	89222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009776	ATC	2	6	89267	89272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009776	CT	3	6	89281	89286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009776	GA	3	6	89310	89315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009776	TAC	2	6	89325	89330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009776	CT	3	6	89353	89358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009776	CCCTT	2	10	89479	89488	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_009776	GA	3	6	89530	89535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009776	TGG	2	6	89656	89661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009776	TA	3	6	89671	89676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009776	CCA	2	6	89686	89691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_009776	GGTG	2	8	89700	89707	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009776	T	6	6	91395	91400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009776	T	6	6	96703	96708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009776	CCCTA	2	10	96726	96735	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_009776	TG	3	6	96756	96761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009776	AGG	2	6	104617	104622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009776	CTA	2	6	108014	108019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009776	GGA	2	6	109718	109723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009776	G	6	6	109836	109841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009776	TCC	2	6	112130	112135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_009776	AT	3	6	112146	112151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009776	CG	3	6	117747	117752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009776	AGG	2	6	117766	117771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009776	CGT	2	6	120402	120407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009776	AG	3	6	120451	120456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009776	ACAT	2	8	127929	127936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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421	NC_009776	CGA	2	6	306585	306590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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